Schéma directeur pour l'amélioration des myrtilles : découvertes génétiques et épigénétiques
Des recherches récentes ont mis en évidence d'importantes variations génétiques et épigénétiques dans les cultivars de myrtilles, en particulier entre les myrtilles en corymbe du Nord (NHB) et les myrtilles en corymbe du Sud (SHB). L'étude met en évidence le rôle de l'introgression génétique dans l'adaptation de la SHB aux climats subtropicaux et identifie des gènes clés, tels que VcTBL44, associés à la fermeté des fruits. Ces résultats offrent des perspectives et des ressources précieuses pour la sélection future des myrtilles.
Structure de la population et diversité génétique des accessions de myrtilles. Arbre phylogénétique du maximum de vraisemblance de 222 accessions de myrtilles. HHB : myrtille demi-haute ; LB : myrtille basse ; NHB : myrtille haute du nord ; RB : myrtille à œil de lapin ; SHB : myrtille haute du sud. B Analyse en composantes principales des deux premières composantes (PC1 et PC2) pour toutes les accessions et les principales accessions de myrtilles cultivées. PC1, première composante principale ; PC2, deuxième composante principale. C Analyse de la structure de la population des accessions de myrtilles cultivées et de V. darrowii pour différents nombres de groupes (K = 2-10). L'axe des y quantifie l'appartenance à un sous-groupe, et l'axe des x montre les différentes accessions. La valeur K marquée en rouge est la valeur K optimale déterminée sur la base de l'erreur de CV. D Diversité nucléotidique (π) et divergence des populations (valeur FST) dans quatre sous-groupes de myrtilles cultivées (calculées à partir du modèle diploïde). Les valeurs dans les cercles représentent la diversité nucléotidique (π) des groupes (les cercles marron, orange, bleu et violet représentent les sous-groupes LB, SHB, NHB et RB, respectivement), et la valeur entre chaque paire indique la divergence de la population (valeur FST).
Horticulture Research
Les myrtilles, qui font partie du genre Vaccinium, sont réputées pour leurs bienfaits nutritionnels et leur demande mondiale croissante. Cependant, leur culture est confrontée à des défis tels que l'adaptabilité au climat et la qualité des fruits. Les myrtilles modernes ont une courte histoire de domestication, principalement grâce à l'hybridation interspécifique. Ces défis nécessitent des recherches plus approfondies sur les facteurs génétiques et épigénétiques qui influencent les caractéristiques des myrtilles.
Des chercheurs de l'université de Pékin et de l'université agricole de Jilin, en collaboration avec des experts internationaux, ont réalisé des avancées significatives dans la recherche génétique sur les myrtilles. Leur étude présente une analyse complète de la variation génomique des myrtilles, marquant ainsi un tournant dans la science agricole.
L'étude comprend le reséquençage du génome entier et le séquençage au bisulfite de divers cultivars de myrtilles afin de comprendre leurs différences génétiques et épigénétiques. Les chercheurs ont identifié une introgression génétique significative de V. darrowii et V. ashei dans le Southern Highbush (SHB), favorisant son adaptation subtropicale. Ils ont découvert le gène VcTBL44, essentiel à la régulation de la fermeté des fruits dans le SHB. En outre, ils ont constaté des différences significatives dans les schémas de méthylation de l'ADN entre le Northern Highbush (NHB) et le SHB, en particulier dans les CHH-DMR associés à la régulation des transposons. Ces résultats permettent de mieux comprendre les mécanismes génétiques et épigénétiques qui ont permis d'améliorer les cultivars de myrtilles, fournissant ainsi des ressources précieuses pour les futurs programmes de sélection visant à améliorer la qualité des fruits et la résistance au climat.
Haiyue Sun, l'un des principaux chercheurs de l'étude, a déclaré : "Notre recherche fournit une carte génétique et épigénétique détaillée des myrtilles, offrant des informations cruciales pour les programmes de sélection. L'identification de gènes clés tels que VcTBL44 ouvre la voie au développement de cultivars présentant une meilleure qualité de fruit et une meilleure adaptabilité au climat."
Les résultats de cette étude ont des implications significatives pour la sélection des myrtilles. Les ressources génétiques et épigénétiques identifiées permettent de développer de nouveaux cultivars plus résistants aux changements climatiques et de meilleure qualité. Cette recherche améliore notre compréhension de la génétique des myrtilles et fournit des outils pratiques aux sélectionneurs pour répondre à la demande croissante des consommateurs pour des myrtilles de haute qualité.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
Publication originale
Zejia Wang, Wanchen Zhang, Yangyan Zhou, Qiyan Zhang, Krishnanand P Kulkarni, Kalpalatha Melmaiee, Youwen Tian, Mei Dong, Zhaoxu Gao, Yanning Su, Hong Yu, Guohui Xu, Yadong Li, Hang He, Qikun Liu, Haiyue Sun; "Genetic and epigenetic signatures for improved breeding of cultivated blueberry"; Horticulture Research, Volume 11, 2024-5-14
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