Pourquoi la colonisation européenne a conduit l'antilope bleue à l'extinction
Une équipe internationale de scientifiques et la start-up Colossal Biosciences décodent l'ADN du sanglier bleu à l'aide d'un logiciel d'analyse informatique de pointe
Une équipe internationale de chercheurs dirigée par l'université de Potsdam a généré et analysé le premier génome nucléaire à large couverture de l'antilope bleue disparue, en coopération avec Colossal Biosciences et le musée d'histoire naturelle de Berlin. Les données génomiques mettent en lumière l'histoire de l'évolution et de l'extinction de l'espèce. L'antilope bleue est la seule espèce de grand mammifère africain à avoir disparu récemment. Les résultats de l'étude, qui viennent d'être publiés dans "Current Biology", montrent que l'espèce était probablement adaptée à une population de petite taille et qu'elle a survécu ainsi pendant des milliers d'années. Toutefois, cela les rendait également sensibles à des impacts soudains tels que la chasse, qui s'est intensifiée après la colonisation européenne de l'Afrique australe.
L'antilope bleue (Hippotragus leucophaeus) était une antilope africaine au pelage gris-bleu, apparentée à la zibeline et à l'antilope rouanne. La dernière antilope bleue a été abattue vers 1800, 34 ans seulement après sa première description scientifique. L'équipe de recherche, qui comprenait des biologistes de l'évolution de Potsdam dirigés par le professeur Michael Hofreiter, a réussi à obtenir un génome à couverture 40 fois supérieure à partir d'un spécimen conservé au Musée suédois d'histoire naturelle. Il s'agit de l'un des cinq spécimens historiques de l'antilope bleue dont l'ADN a été validé.
Une faible diversité génomique et une taille de population réduite sont souvent considérées comme un inconvénient, car elles peuvent entraîner une diminution de l'aptitude et de l'adaptabilité d'une espèce. "Cependant, l'antilope bleue a eu une population de petite taille pendant plusieurs millénaires avant de disparaître vers 1800", explique Michael Hofreiter. "Le fait qu'aucune consanguinité et seulement quelques mutations nuisibles n'aient été détectées indique que l'espèce était adaptée à une faible taille de population à long terme", ajoute Elisabeth Hempel, qui a étudié l'antilope bleue dans le cadre de sa thèse de doctorat à l'université de Potsdam et au Muséum d'histoire naturelle de Berlin.
L'analyse de la taille de la population à long terme montre également qu'elle n'a pas été influencée par les fluctuations climatiques de la période glaciaire. Ce résultat est inattendu pour un grand mammifère herbivore, car ces cycles auraient dû entraîner des changements dans la disponibilité de l'habitat. Ce résultat suggère que les modèles actuels de dynamique à long terme des écosystèmes de la région doivent être affinés.
Les chercheurs ont conclu de leurs résultats que les espèces peuvent survivre longtemps avec une population de petite taille tant qu'elles ne sont pas exposées à des perturbations à action rapide. Par conséquent, l'influence soudaine de l'homme lors de la colonisation européenne de l'Afrique australe au XVIIe siècle a probablement joué un rôle central dans l'extinction de l'espèce.
Au cours des analyses d'ADN, deux gènes ont également été identifiés dans le génome qui pourraient être responsables de la couleur bleue de la peau de l'espèce, à laquelle l'antilope bleue doit son nom. Ceci a été rendu possible grâce à un logiciel d'analyse computationnelle de pointe de la société de biotechnologie Colossal Bioscience, avec laquelle les chercheurs ont collaboré. "Dans le cadre de l'intérêt constant que Colossal porte à l'ADN ancien, aux relations entre génotype et phénotype et à la restauration des écosystèmes, nous avons été honorés de collaborer aux travaux novateurs du professeur Hofreiter et de son équipe", a déclaré Ben Lamm, cofondateur et PDG de Colossal Bioscience. "Les objectifs de recherche du projet ont permis à nos équipes de travailler ensemble en appliquant certains des derniers algorithmes de Colossal en matière d'ADN ancien et de génomique comparative afin d'apprendre ce qui a vraiment fait de l'antilope bleue l'espèce unique qu'elle était."
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
Publication originale
Elisabeth Hempel, J. Tyler Faith, Michaela Preick, Deon de Jager, Scott Barish, Stefanie Hartmann, José H. Grau, Yoshan Moodley, Gregory Gedman, Kathleen Morrill Pirovich, Faysal Bibi, Daniela C. Kalthoff, Sven Bocklandt, Ben Lamm, Love Dalén, Michael V. Westbury, Michael Hofreiter; "Colonial-driven extinction of the blue antelope despite genomic adaptation to low population size"; Current Biology
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