Le dépistage génétique avant la grossesse permet de détecter jusqu'à la moitié du risque
Les futurs parents courent-ils un risque génétique de maladies graves qu'ils pourraient potentiellement transmettre à leurs enfants ?
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L'utilisation de biomarqueurs et de tests génétiques pendant la grossesse est désormais extrêmement répandue. Mais que se passerait-il si les gènes des deux parents étaient largement analysés pour détecter d'éventuels risques avant la conception ? Existe-t-il dans le génome des maladies héréditaires rares dont le père et/ou la mère sont porteurs à leur insu ? Si les deux parents ont le même défaut génétique dans leurs gènes et qu'ils le transmettent tous deux à leur enfant, ce dernier sera souvent atteint d'une maladie grave.
Dans de nombreuses régions des États-Unis, un vaste dépistage génétique est proposé aux futurs parents et est généralement aussi recommandé en début de grossesse. Les dépistages indiquent principalement les gènes hérités de manière récessive qui ne sont pas spécifiques au sexe - en d'autres termes, ceux qui n'ont un effet que si les deux copies du gène sont porteuses d'une mutation. Les gènes récessifs sur le chromosome X constituent un cas particulier, les mères en bonne santé pouvant transmettre ce gène à leurs enfants. Toutefois, normalement, seuls les fils souffrent des conséquences de cette mutation, car ils ne portent qu'un seul chromosome X et ne disposent donc pas d'une deuxième copie du gène pour compenser le défaut.
Plus de 3 000 facteurs héréditaires testés
Ces tests génétiques pour les facteurs de risque héréditaires tiennent-ils leurs promesses ? Anita Rauch, directrice du département de génétique médicale de l'université de Zurich, et son équipe en Suisse ont pour la première fois répondu à cette question en étudiant de manière approfondie le potentiel et les pièges de ce dépistage élargi des porteurs (ECS). À cette fin, les scientifiques ont testé les données séquentielles de 700 parents ayant déjà eu des enfants atteints de troubles du développement neurologique. Parmi les plus de 3 000 gènes étudiés, beaucoup peuvent être à l'origine de déficiences intellectuelles, de troubles du développement, d'autisme et d'autres troubles.
"Dans notre étude, nous avons pu montrer que ce type de test génétique à grande échelle permet de détecter le risque que l'enfant soit atteint d'un trouble grave du développement dans environ 44 % des cas si les parents sont liés par le sang - par exemple en tant que cousins germains ou cousines germaines", explique Anita Rauch. Dans certains groupes de population, cette situation est assez courante, par exemple au Moyen-Orient ou en Afrique du Nord.
Des lacunes dans la détection des risques, en particulier pour les couples non consanguins
Le test permet encore de détecter environ 5 % des cas chez les couples non consanguins, mais uniquement si tous les gènes récessifs connus sont étudiés. Or, selon les recommandations américaines, les couples non consanguins ne devraient être testés que pour les gènes communs dont on sait qu'ils sont porteurs à une certaine fréquence dans la population. "Suivre la recommandation américaine réduirait de plus de moitié le taux de détection du risque, car des gènes plus rares jouent également un rôle ici", explique Rauch.
Chez les enfants de couples non consanguins, une proportion nettement plus élevée de troubles du développement est due à des mutations de novo non héréditaires, alors que chez les enfants de parents apparentés, les défauts génétiques héréditaires jouent un rôle nettement plus important. Pour cette raison, les chercheurs affirment que la probabilité de détecter des risques en analysant les gènes des parents est limitée pour les couples non consanguins.
De nombreux gènes pathogènes ne sont toujours pas détectés
D'autres facteurs ont également une incidence sur la capacité de ces tests à détecter les variantes génétiques problématiques dans les gènes pathogènes connus : en particulier, les mutations génétiques faux-sens, dans lesquelles le plan génétique peut ou non être modifié, et les variantes héréditaires du nombre de copies, dans lesquelles le nombre de copies du gène est incorrect, ont été sous-estimées. Les cas qui ne peuvent être détectés sont généralement ceux dans lesquels une anomalie génétique héréditaire et une anomalie génétique nouvellement acquise se produisent en même temps.
En outre, il existe probablement plusieurs milliers de gènes non encore identifiés qui sont également à l'origine de troubles du développement. Par exemple, dans la cohorte étudiée, la cause du trouble du développement chez les enfants concernés est restée inexpliquée dans environ 58 % des cas.
Une décision consciente pour ou contre les enfants
Néanmoins, selon les chercheurs, l'étude fournit des données sur la pertinence d'un dépistage élargi des porteurs. Sur la base du taux élevé de détection du risque chez les parents consanguins, les chercheurs estiment que ce dépistage devrait certainement être proposé à ces couples. Dans tous les autres cas, les avantages et les inconvénients doivent être évalués au cas par cas pour éviter de créer des attentes irréalistes. "S'il s'avère qu'un couple présente un risque d'avoir des enfants atteints de troubles du développement neurologique, il sera pleinement conscient et capable de décider s'il veut ou non avoir des enfants ensemble ou envisager un diagnostic prénatal ou préimplantatoire", déclare Rauch.
Toutefois, les résultats montrent également que la réduction potentielle du risque dépend fortement des gènes sélectionnés et de la classification des variantes dans le test. Selon Rauch, il existe encore un potentiel d'amélioration des tests proposés actuellement : "Pour améliorer le bénéfice clinique, il faudrait envisager de soumettre tous les couples qui souhaitent un test génétique large au dépistage de tous les gènes récessifs, quelle que soit la prévalence d'une variante génétique dans la population. Les laboratoires devraient également utiliser des seuils raisonnables concernant le moment où un défaut génétique est considéré comme pathogène."
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