Descubrimiento de la biodiversidad 4.0 para todos
Tecnología de secuenciación de vanguardia que cabe en cualquier bolsillo del pantalón
Científicos del Museum für Naturkunde de Berlín, junto con colegas de la Universidad Nacional de Singapur, han logrado optimizar y simplificar un método de identificación de especies mediante un sistema de "código de barras" genético y un pequeño y económico dispositivo de secuenciación. El nuevo método requiere un mínimo de materiales de bajo coste y es lo suficientemente sencillo como para que cualquiera pueda llevarlo a cabo en el lugar del descubrimiento y complementar los conocimientos científicos de los investigadores.
Imagen simbólica
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Desde hace décadas se viene observando un descenso de la biodiversidad en todo el mundo. Según las proyecciones de Swiss Re, la pérdida de especies pone en peligro a las comunidades animales y vegetales y podría provocar el colapso de los ecosistemas en numerosos países del mundo. "El descubrimiento de especies y el control de la biodiversidad serán, por tanto, cada vez más importantes en el futuro", afirma el profesor Rudolf Meier, director del Centro para el Descubrimiento Integrativo de la Biodiversidad del Museum für Naturkunde de Berlín. "Todos los países necesitarán información en tiempo real sobre la distribución y abundancia de las especies para desarrollar estrategias y medidas de conservación eficaces".
En vista de ello, el objetivo de los investigadores era desarrollar un método sencillo, de bajo coste pero de gran calidad, que permitiera investigar la biodiversidad en cualquier parte del mundo. Para ello utilizaron una tecnología de secuenciación de última generación. Los llamados MinION caben en el bolsillo de cualquier pantalón y pueden ofrecer resultados en muy poco tiempo y apoyar el trabajo científico de los investigadores.
Para que los secuenciadores MinION fueran adecuados para el descubrimiento de especies a gran escala, los científicos tuvieron que asegurarse primero de que el pequeño dispositivo pudiera leer el código genético con gran precisión. "Afortunadamente, conseguimos simplificar los pasos hasta el punto de reducir el coste de la secuenciación a menos de 10 céntimos por espécimen", explica la Dra. Amrita Srivathsan, primera autora del estudio. "El bajo coste y la facilidad de manejo son fundamentales para permitir el descubrimiento generalizado de la biodiversidad y el seguimiento de las especies".
Debido a la sencillez del método, incluso los no científicos pueden ahora aprender a identificar y estudiar especies animales en el jardín, el campo o el bosque utilizando el sistema MinION en pocos días, gracias en gran parte al desarrollo de una nueva herramienta bioinformática de acceso libre llamada ONTbarcoder que hace que los resultados de MinION sean interpretables para todo el mundo.
"Estamos convencidos de que el método presentado contribuirá a la protección de la biodiversidad y ayudará a una gran variedad de interesados en la investigación de la biodiversidad, como organizaciones gubernamentales, universidades, museos y asociaciones privadas", comentó el profesor Meier.
Los científicos ya han demostrado de forma impresionante el impacto de este tipo de códigos de barras a gran escala en otro estudio. Un proyecto sobre los manglares de Singapur reveló una diversidad de insectos sorprendentemente alta en este ecosistema. Anteriormente, se suponía que sólo había unas pocas especies de insectos en esta zona debido a la escasa diversidad de plantas. Pero gracias a la utilización de flujos de trabajo rápidos, los autores han podido demostrar que los manglares son un punto caliente hasta ahora insuficientemente observado para una gran variedad de especies de insectos.
Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Inglés se puede encontrar aquí.
Publicación original
Srivathsan, A., Lee, L., Katoh, K., Hartop, E., Narayanan Kutty, S., Wong, J., Yeo, D. & Meier, R.; "ONTbarcoder and MinION barcodes aid biodiversity discovery and identification by everyone, for everyone"; BMC Biology; (2021) 19:217.
Yeo, D., Srivathsan, A., Puniamoorthy, J., Maosheng, F., Grootaert, P., Chan, L., Guénard, B., Damken, C., Wahab, R. A., Yuchen, A. & Meier, R.; "Mangroves are an overlooked hotspot of insect diversity despite low plant diversity"; BMC Biology; (2021) 19:202.
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