Un modèle d'IA trouve les indices du cancer à la vitesse de l'éclair
Fini les heures, voire les jours, de travail de détective !
Des chercheurs de l'université de Göteborg ont mis au point un modèle d'intelligence artificielle qui augmente le potentiel de détection du cancer grâce à l'analyse du sucre. Le modèle d'IA est plus rapide et plus efficace pour détecter les anomalies que la méthode semi-manuelle actuelle.
Les glycanes, ou structures des molécules de sucre dans nos cellules, peuvent être mesurés par spectrométrie de masse. Les structures peuvent indiquer différentes formes de cancer dans les cellules, ce qui constitue une utilisation importante.
Toutefois, les données issues de la mesure par spectrométrie de masse doivent être soigneusement analysées par des humains afin de déterminer la structure à partir de la fragmentation des glycanes. Ce processus peut prendre des heures ou des jours pour chaque échantillon et ne peut être réalisé avec une grande confiance que par un petit nombre d'experts dans le monde, car il s'agit essentiellement d'un travail de détective appris au fil de nombreuses années.
Automatiser le travail de détective
Le processus constitue donc un goulot d'étranglement dans l'utilisation des analyses de glycanes, par exemple pour la détection du cancer, lorsqu'il y a de nombreux échantillons à analyser.
Des chercheurs de l'université de Göteborg ont mis au point un modèle d'IA pour automatiser ce travail de détective. Le modèle d'IA, baptisé Candycrunch, résout la tâche en quelques secondes seulement par test. Les résultats sont présentés dans un article scientifique publié dans la revue Nature Methods.
Le modèle d'IA a été entraîné à l'aide d'une base de données de plus de 500 000 exemples de fragmentations différentes et de structures associées de molécules de sucre.
"L'entraînement a permis à Candycrunch de calculer la structure exacte du sucre dans un échantillon dans 90 % des cas", explique Daniel Bojar, maître de conférences associé en bio-informatique à l'université de Göteborg.
Peut trouver de nouveaux biomarqueurs
Cela signifie que le modèle d'IA pourrait bientôt atteindre les mêmes niveaux de précision que le séquençage d'autres séquences biologiques, telles que l'ADN, l'ARN ou les protéines.
Grâce à la rapidité et à la précision de ses réponses, le modèle d'IA peut accélérer la découverte de biomarqueurs basés sur les glycanes pour le diagnostic et le pronostic du cancer.
"Nous pensons que les analyses des glycanes vont prendre une part plus importante dans la recherche biologique et clinique, maintenant que nous avons automatisé le plus gros goulot d'étranglement", déclare Daniel Bojar.
Le modèle d'IA Candycrunch est également capable d'identifier des structures qui échappent souvent aux analyses humaines en raison de leur faible concentration. Le modèle peut donc aider les chercheurs à trouver de nouveaux biomarqueurs à base de glycanes.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
Publication originale
Autres actualités du département science
Recevez les dernières actualités du secteur des sciences de la vie
Ne manquez plus aucune actualité : notre newsletter consacrée aux biotechnologies, au secteur pharmaceutique et aux sciences de la vie vous informe tous les mardis et jeudis. Les dernières nouvelles du secteur, les produits phares et les innovations - de manière compacte et compréhensible dans votre boîte de réception. Recherché par nos soins, pour que vous n'ayez pas à le faire.
