L'intelligence artificielle au service de la découverte d'anticorps thérapeutiques
Un ancien chercheur de l'EMBL fonde une start-up - DenovAI - pour une découverte d'anticorps plus large, plus rapide et moins coûteuse grâce à l'apprentissage automatique et à la biophysique computationnelle
Les anticorps sont un outil important dans l'arsenal du système immunitaire humain contre les maladies. Ils se fixent sur les bactéries, les virus, les champignons ou les toxines, les marquant pour les détruire ou les éliminer de l'organisme.
Légende : Les scientifiques de l'EMBL qui ont développé la technologie basée sur l'IA pour concevoir les protéines que DenovAI exploitera. De gauche à droite : Michael Jendrusch, Kashif Sadiq, Jan Korbel.
Kinga Lubowiecka / EMBL
C'est cette capacité à reconnaître et à marquer les molécules et les organismes étrangers et nocifs qui permet l'utilisation thérapeutique des anticorps, notamment pour traiter ou prévenir des maladies telles que le cancer, ainsi que les maladies auto-immunes et métaboliques. Mais si les anticorps thérapeutiques offrent un grand potentiel, la sélection d'un candidat prometteur parmi des milliards de séquences d'anticorps potentielles est laborieuse, coûteuse et, dans de nombreux cas, inefficace pour identifier des anticorps fonctionnels.
Pour relever ce défi, Kashif Sadiq, ancien collaborateur scientifique de l'EMBL, a récemment fondé une jeune entreprise : DenovAI Biotech. Cette société créera une plateforme dans le domaine de la conception de protéines de novo, une approche computationnelle permettant de concevoir des protéines à partir de zéro, plutôt que d'utiliser une structure connue. L'entreprise développera principalement une solution biophysique alimentée par l'IA qui peut découvrir des anticorps potentiels et des petites protéines biologiques et suggérer lesquelles pourraient être utilisées à des fins thérapeutiques. Dans un avenir proche, elle pourrait également fournir des capacités au-delà des produits biologiques pharmaceutiques, notamment pour le diagnostic, la conception d'enzymes et de biomatériaux. Le DenovAI s'appuiera sur les avancées récentes en matière de prédiction de la structure des protéines, d'algorithmes d'intelligence artificielle, de techniques de biophysique moléculaire computationnelle et de disponibilité accrue des structures antigène-anticorps déterminées expérimentalement.
Grâce au DenovAI, M. Sadiq entend combiner l'intelligence artificielle et la biophysique pour découvrir les séquences et les structures des anticorps capables de reconnaître et de se lier fortement à n'importe quel antigène protéinique. "Ce type d'approche n'a jamais été adopté auparavant", a déclaré M. Sadiq. "Nous avons assisté à des avancées majeures dans le domaine des anticorps thérapeutiques, depuis l'augmentation de la taille des bibliothèques d'anticorps jusqu'à la découverte axée sur la fonction, mais le processus de développement de nouveaux médicaments reste incroyablement lent, extrêmement coûteux et inefficace. Avec le soutien d'AION Labs et de ses partenaires, nous espérons mettre au point une solution de pointe qui bouleversera l'ensemble du secteur, en réduisant les délais de découverte de plusieurs mois à quelques jours. Cela pourrait élargir considérablement le champ d'application de la thérapie par anticorps à de nombreuses autres maladies."
DenovAI est la deuxième startup créée par AION Labs, basée en Israël, qui crée des startups grâce à un modèle d'innovation unique alimenté par BioMed X. Après avoir identifié des défis spécifiques en matière de R&D dans l'industrie, elle effectue une recherche mondiale de talents pour trouver des scientifiques fondateurs. DenovAI bénéficie de l'investissement de grandes entreprises pharmaceutiques telles que Pfizer, AstraZeneca, Merck et Teva, du soutien étroit d'Amazon Web Services (AWS) et du soutien financier supplémentaire de l'Autorité israélienne de l'innovation et du Fonds israélien pour la biotechnologie.
"Située à l'intersection de la biophysique, de la biotechnologie et de l'IA, DenovAI a le potentiel de révolutionner l'innovation dans le domaine de la découverte de médicaments. C'est notre objectif commun", a déclaré Mati Gill, PDG d'AION Labs. "Nous nous réjouissons de mettre à la disposition de DenovAI nos solides ressources et notre mentorat, alors que nous travaillons ensemble au développement d'une solution pour surmonter le défi pharmaceutique que représente la sélection de médicaments candidats à partir de séquences d'anticorps."
Lorsqu'il travaillait dans le groupe de recherche de Jan Korbel à l'EMBL Heidelberg, Sadiq et Michael Jendrusch, doctorant à l'EMBL, ont inventé une technologie pilotée par l'IA pour concevoir des protéines. Avec DenovAI, Sadiq a l'intention d'exploiter cette technologie, dont la licence a été concédée à la société par la filiale commerciale de l'EMBL : EMBL Enterprise Management Technology Transfer GmbH (EMBLEM). M. Jendrusch contribuera également aux efforts de l'entreprise tout en terminant son doctorat à l'EMBL Heidelberg. "C'est une opportunité fantastique pour moi de participer à la traduction de notre recherche théorique en applications concrètes", a déclaré M. Jendrusch.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
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