Une analyse du sucre pourrait révéler différents types de cancer

À l'avenir, un peu de salive pourrait suffire à détecter un cancer naissant

15.12.2023

Des chercheurs de l'université de Göteborg ont mis au point un moyen efficace d'interpréter les modifications des molécules de sucre qui se produisent dans les cellules cancéreuses. Les glycanes sont un type de structures de molécules de sucre liées aux protéines de nos cellules. La structure du glycan détermine la fonction de la protéine. On sait depuis un certain temps que des changements dans la structure des glycanes peuvent indiquer une inflammation ou une maladie dans l'organisme. Aujourd'hui, des chercheurs de l'université de Göteborg ont mis au point un moyen de distinguer les différents types de changements structurels, ce qui pourrait apporter une réponse précise à la question de savoir ce qui va changer dans le cas d'une maladie spécifique.

"Nous avons analysé les données d'environ 220 patients atteints de 11 cancers différents et avons identifié des différences dans la sous-structure du glycane en fonction du type de cancer. En laissant notre nouvelle méthode, améliorée par l'IA, travailler sur de grandes quantités de données, nous avons pu trouver ces connexions", explique Daniel Bojar, maître de conférences associé en bioinformatique à l'université de Göteborg et auteur principal de l'étude publiée dans Cell Reports Methods.

Une méthode améliorée par l'IA a permis de trouver les schémas

D'autres groupes de recherche étudient les sous-structures du glycane à la recherche de biomarqueurs qui décrivent ce qui ne va pas. Il s'agit souvent de tests statistiques utilisant la spectroscopie de masse pour déterminer si le niveau des sucres individuels est significativement plus élevé ou plus bas dans le cancer. Ces tests ont une sensibilité trop faible et ne sont pas fiables car les différents sucres sont structurellement liés et ne sont donc pas indépendants les uns des autres.

L'équipe de recherche de Daniel Bojar utilise une nouvelle méthode intégrant l'IA, qui tient compte de ces problèmes et peut trouver des modèles dans les ensembles de données là où d'autres échouent.

"Nous pouvons nous fier à nos résultats ; ils sont statistiquement significatifs. Si nous savons ce que nous cherchons, il est plus facile de trouver le bon résultat. Nous allons maintenant utiliser ces biomarqueurs et développer des méthodes de test", explique Daniel Bojar.

Nouveau spectromètre de masse

Au cours de l'automne, son groupe de recherche a reçu 4 millions de couronnes suédoises de la Fondation Lundberg pour acheter un spectromètre de masse ultramoderne. Cet instrument servira de plateforme d'intelligence artificielle pour aider les chercheurs dans l'étude des glycanes, par exemple dans les échantillons de cancer du poumon. L'objectif est de détecter le cancer plus tôt afin d'améliorer les chances de guérison.

"Nous voulons développer une méthode d'analyse fiable et rapide pour détecter le cancer, ainsi que le type de cancer, à partir d'un échantillon de sang ou de salive. Je pense que nous pourrons effectuer des tests cliniques sur des échantillons humains d'ici 4 à 5 ans", déclare Daniel Bojar.

Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.