Lignes directrices globales pour améliorer la qualité des images de microscopie dans les publications scientifiques
Dans le cadre d'une initiative mondiale, des chercheurs ont élaboré des lignes directrices pour la publication d'images de microscopie dans des publications scientifiques. Les critères, résumés sous forme de listes de contrôle, constituent la base pour garantir que les images publiées dans le domaine des sciences de la vie et de la médecine sont intelligibles et reproductibles. C'est la seule façon d'exploiter pleinement leur potentiel pour la recherche. Les résultats obtenus par un groupe dirigé par un scientifique du NCT/UCC de Dresde et de la médecine universitaire de Dresde sont susceptibles d'influencer les pratiques de publication mondiales concernant les images de microscopie. Ils ont été publiés dans la revue Nature Methods.
Plus d'un million d'articles scientifiques sont publiés chaque année dans le domaine des sciences de la vie et de la médecine. Environ un tiers d'entre eux contiennent des images, telles que des photos de cellules ou de tissus. Cependant, la plupart de ces images ne peuvent pas être pleinement comprises par le public cible, par exemple parce qu'il manque des informations sur l'échelle. En outre, beaucoup ne contiennent pas d'informations sur la manière exacte dont les images ont été produites, ce qui empêche d'autres chercheurs de reproduire des images comparables.
Dans le cadre de l'initiative mondiale sur l'évaluation de la qualité et la reproductibilité des instruments et des images en microscopie optique, un groupe de travail spécialisé a élaboré des lignes directrices en matière de communication, en particulier pour les images de microscopie et les données d'analyse d'images.
"Les scientifiques du monde entier et les principales revues scientifiques ont signalé un besoin urgent de normes de publication pour les images de microscopie", explique le Dr Helena Jambor, initiatrice du groupe de travail responsable des lignes directrices, qui est également le dernier auteur de l'article scientifique et travaille comme scientifique au Centre national des maladies tumorales de Dresde (NCT/UCC) et à la médecine universitaire de Dresde. "Ces lignes directrices doivent être élaborées par les chercheurs, car ce sont eux qui savent le mieux quels critères de qualité sont particulièrement importants pour leur travail. Nous sommes parvenus à un large consensus, avec la participation de chercheurs de nombreux instituts de pointe dans le domaine des sciences de la vie".
Les principaux critères sont résumés dans des listes de contrôle claires à suivre lors de la publication d'images de microscopie. Il s'agit, par exemple, de s'assurer que les sections d'images pertinentes sont sélectionnées, que les canaux de couleur sont nommés dans les images de microscopie à fluorescence et que les couleurs choisies peuvent être distinguées par les lecteurs daltoniens. De nombreuses publications présentent également des résultats d'analyses d'images. Dans ce cas, il est important que les auteurs décrivent précisément comment les données ont été générées, par exemple quelles solutions logicielles et commandes d'entrée ont été utilisées, et que des échantillons de données soient disponibles pour vérifier les résultats. En général, les images doivent être mises à la disposition de la communauté scientifique dans des bases de données appropriées, de manière à ce qu'elles puissent être utilisées pour d'autres recherches.
"Les lignes directrices s'adressent à tous les chercheurs qui travaillent avec la microscopie optique, des débutants aux experts", explique le Dr Christopher Schmied, premier auteur de l'article de recherche, qui travaille comme scientifique à la Fondation Technopole Humaine à Milan et au Leibniz-Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie (FMP) à Berlin. "Elles permettent de publier des images et des résultats d'analyse d'images qui répondent à des normes de qualité élevées, qui sont reproductibles et donc plausibles, et qui constituent une bonne base pour d'autres projets de recherche.
Dans les listes de contrôle, les critères sont divisés en trois niveaux afin que les utilisateurs puissent choisir entre les exigences minimales, recommandées et idéales pour une bonne communication d'images. "Notre objectif est que les critères soient utilisés par les principales revues scientifiques comme normes contraignantes pour la publication", déclare le Dr Jambor. "Les chances sont bonnes. Les membres de l'initiative mondiale mettent constamment à jour les listes de contrôle. Nous allons également développer du matériel de formation à la communication et des tutoriels pour les images de microscopie.
"Les images de microscopie et les analyses d'images jouent un rôle de plus en plus important pour la recherche, en partie grâce aux progrès technologiques de ces dernières années", explique le professeur Michael Albrecht, directeur médical de l'hôpital universitaire de Dresde. Michael Albrecht, directeur médical de l'hôpital universitaire de Dresde. "Pour pouvoir exploiter pleinement ce potentiel, il est important de disposer de normes de publication uniformes. Nous sommes ravis que les scientifiques de Dresde mènent des efforts importants dans ce domaine".
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
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