El rápido análisis del genoma de un lebrel Whippet establece un nuevo estándar para la investigación de la biodiversidad
"Estamos demostrando que podemos obtener y analizar información completa del genoma en cuestión de días, no de meses"
La continua pérdida de biodiversidad en el mundo hace cada vez más necesario recopilar y analizar con rapidez información genética sobre especies amenazadas. En un proyecto conjunto, el Departamento de Genética Humana del Bioscientia Institute for Medical Diagnostics GmbH de Ingelheim am Rhein y el LOEWE Centre for Translational Biodiversity Genomics (LOEWE-TBG) de Fráncfort, ambos en Alemania, han secuenciado y analizado el genoma completo de un lebrel Whippet en menos de una semana. Este avance podría tener repercusiones duraderas en la investigación genómica para la conservación de especies y biodiversidad. El estudio se ha publicado en la revista "GigaByte".
El análisis del genoma de un Whippet, realizado conjuntamente por el Instituto Bioscientia y el Centro LOEWE TBG, utilizó una nueva tecnología: los genomas completos se secuencian con gran precisión y en largas secciones, las llamadas "long reads". Esto se logró en un tiempo récord utilizando el ejemplo del Whippet, uno de los animales terrestres más rápidos. No se trata sólo de un éxito técnico, sino que se inició como un proyecto simbólico para afrontar el reto de la extinción de especies.
"Estamos demostrando que podemos obtener y analizar información completa del genoma en cuestión de días, no de meses", explica el Prof. Dr. Hanno Bolz, Jefe de Genética Humana de Bioscientia. La novedosa colaboración entre los genetistas humanos de Bioscientia y los investigadores del LOEWE Centre TBG establece un nuevo estándar y proporciona una herramienta eficaz para la investigación de la biodiversidad.
Los análisis rápidos son cada vez más importantes para la conservación de especies amenazadas, ya que el tiempo es esencial ante la rápida pérdida de biodiversidad. "Con este tipo de proyectos, podemos proporcionar rápidamente información genética importante sobre especies amenazadas. Esto nos ayuda no sólo a comprender sus adaptaciones evolutivas, sino también a desarrollar medidas de conservación específicas", afirma la Dra. Carola Greve, jefa del laboratorio del LOEWE Centre TBG. Además del proyecto Whippet, en breve se publicará otro estudio conjunto de ambos investigadores sobre el lirón careto, especie en peligro de extinción. Ya están en marcha otros proyectos conjuntos de secuenciación.
En el Departamento de Genética Humana del Instituto Bioscientia, unos 100 expertos analizan cada año miles de genomas, así como las regiones de los genomas que codifican proteínas, conocidas como exomas, para identificar las causas de enfermedades genéticas raras en pacientes de todo el mundo. Bioscientia es el primer laboratorio que aplica el innovador método de secuenciación genómica de "lectura larga" utilizado en el estudio del lebrel al diagnóstico genético humano. Esto permitirá identificar enfermedades genéticas en humanos de forma más eficiente, con el potencial de mejorar significativamente las opciones de tratamiento.
Los científicos del Centro LOEWE TBG, con sede en la Sociedad Senckenberg para la Investigación de la Naturaleza de Fráncfort del Meno (Alemania), están secuenciando los genomas de muchos organismos no humanos, desde bacterias hasta ballenas. La información proporciona datos valiosos sobre plantas y animales, muchos de ellos en peligro de extinción, así como conocimientos sobre sus relaciones biológicas, evolución y adaptaciones a las condiciones ambientales. Esto beneficia a la investigación básica y aplicada, incluida la gestión de la conservación.
Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Inglés se puede encontrar aquí.
Publicación original
Marcel Nebenführ, David Prochotta, Alexander Ben Hamadou, Axel Janke, Charlotte Gerheim, Christian Betz, Carola Greve, Hanno Jörn Bolz; "High-speed whole-genome sequencing of a Whippet: Rapid chromosome-level assembly and annotation of an extremely fast dog’s genome"; Gigabyte, Volume 2024, 2024-9-13
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