Una nueva e importante herramienta para el desarrollo de los tratamientos de COVID-19, las vacunas
Una nueva herramienta está ayudando a los científicos a entender mejor COVID-19
Los científicos biomédicos que trabajan con Covid-19 tienen una nueva herramienta para ayudarles a comprender mejor el virus y a sentirse seguros de los modelos estructurales que están utilizando en sus investigaciones.
Una nueva herramienta está ayudando a los científicos a entender mejor COVID-19
Illustration by Marcin Minor
El Dr. Wladek Minor, de la Facultad de Medicina de la Universidad de Virginia, y otros biólogos estructurales de alto nivel han dirigido un equipo internacional de científicos para investigar las estructuras de las proteínas contenidas en el virus, estructuras que son vitales para el desarrollo de tratamientos y vacunas. El equipo ha creado un recurso en la Web que proporciona a los científicos una forma fácil de ver el progreso de la comunidad de biología estructural en esta área. También incluye la evaluación del equipo sobre la calidad de los modelos individuales y las versiones mejoradas de estas estructuras, cuando sea posible.
"Hemos analizado cuidadosamente los modelos disponibles de las proteínas del SARS-CoV-2 y presentamos los resultados con el objetivo de ayudar a la amplia comunidad biomédica. Los modelos estructurales son, en última instancia, la interpretación de los investigadores originales y a veces no son óptimos. Por eso es tan crucial un segundo par de ojos para validar las estructuras importantes", dijo Minor, del Departamento de Fisiología Molecular y Física Biológica de la UVA. "En la mayoría de los casos, sólo se podrían sugerir correcciones menores. Sin embargo, en varios casos, las revisiones fueron significativas, especialmente en el área sensible de los complejos proteína-ligando que son críticos para la investigación de seguimiento, como el trabajo de descubrimiento de fármacos. La actual crisis sanitaria exige que todas las estructuras del SARS-CoV-2 sean de la mayor calidad posible".
La ciencia a la velocidad del rayo
Cuando la amenaza del coronavirus se hizo evidente, los científicos de todo el mundo respondieron a un ritmo sin precedentes para determinar la estructura atómica del virus y sus componentes proteicos.
Los investigadores están utilizando los modelos estructurales resultantes en una variedad de aplicaciones, que van desde el diseño de fármacos basados en la estructura hasta la planificación de una serie de experimentos biomédicos. Por esa razón, es esencial que los modelos atómicos sean lo más precisos posible. Debido a la urgencia de la pandemia, la mayoría de estas estructuras se depositan en el Banco de Datos de Proteínas (PDB), un depósito mundial de estructuras macromoleculares, antes de su publicación y revisión por pares.
Los miembros del equipo, que son expertos en validación e interpretación de estructuras, observaron oportunidades para mejorar varios modelos de SARS-CoV-2 utilizando enfoques de refinamiento de última generación. Eso les llevó a crear el nuevo recurso de la web. Se actualiza con nuevas estructuras semanalmente, en sincronía con el PDB.
En algunos casos, el equipo ha trabajado con los investigadores que generaron la estructura original para asegurarse de que el sitio contiene los modelos más precisos. Este equipo tiene una larga experiencia en la corrección de modelos estructurales de importancia biomédica, por ejemplo, en el campo de la resistencia a los antibióticos.
"Trabajar en un proyecto impulsado por fuertes colaboraciones internacionales es una enorme oportunidad para los científicos más jóvenes, como Ivan Shabalin y Dariusz Brzezinski, que sin duda dirigirán otros estudios de gran impacto en el futuro próximo", dijo Minor.
"Es extremadamente gratificante poder añadir mi experiencia a un proyecto que tiene el potencial de tener un inmenso impacto en las vidas de millones de personas", dijo Shabalin.
Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Inglés se puede encontrar aquí.
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