La biologie synthétique révèle les secrets de la vie sans oxygène
Bourse avancée du CER pour le chercheur en produits naturels Christian Hertweck
Anna Schroll/Leibniz-HKI
Bien avant que la photosynthèse n'introduise l'oxygène libre dans le monde, la terre était déjà peuplée de nombreux organismes. L'oxygène mettait leur vie en danger et ils ont donc développé des voies métaboliques complètement différentes de celles que nous connaissons chez les plantes, les animaux et les humains. Les bactéries anaérobies ont traversé les âges dans des niches spéciales, dépourvues d'oxygène, dont certaines sont très proches de nous : elles constituent une partie essentielle du microbiome intestinal, où elles sont extrêmement importantes pour le bien-être de l'organisme. Toutefois, certains anaérobies peuvent également déclencher des maladies mortelles telles que le tétanos ou le botulisme. Ces bactéries ont donc une influence considérable sur la qualité de la vie sur terre et occupent une position clé dans l'environnement. Leur métabolisme particulier en fait également des outils recherchés en biotechnologie.
Le projet "AnoxyGen" vise à libérer l'immense potentiel de biosynthèse des anaérobies, jusqu'ici inexploité. Malgré leur capacité à former de nouveaux composés, la plupart de ces gènes de biosynthèse sont inactifs en laboratoire, de sorte que leurs produits n'ont pas été découverts jusqu'à présent.
Hertweck et son équipe veulent maintenant changer cela. À l'aide d'outils de biologie moléculaire et synthétique nouvellement développés, les chercheurs veulent décoder et exploiter les voies métaboliques encore inconnues de ces bactéries. Le projet comprend plusieurs domaines de travail dans lesquels un puissant système d'expression est utilisé pour identifier et modifier de nouveaux composés actifs. Cela permettra également à l'équipe de produire et d'étudier les toxines et les facteurs de virulence des anaérobies pathogènes sans avoir à cultiver de grandes quantités de ces pathogènes.
"Avec ce projet, nous voulons fournir de nouvelles méthodes et de nouveaux outils à la communauté scientifique. Nous espérons que 'AnoxyGen' sera d'une grande utilité, en particulier pour la médecine, mais aussi pour l'écologie et la biotechnologie", explique Hertweck. "Les bactéries anaérobies font encore l'objet de peu de recherches, mais leurs processus métaboliques offrent un grand potentiel pour la découverte de nouveaux composés actifs. Nous pouvons également obtenir de nouvelles informations sur leur rôle en tant qu'agents pathogènes". Hertweck, qui a déjà reçu le prix Gottfried Wilhelm Leibniz et le prix Ernst Jung de médecine pour sa grande créativité scientifique dans l'identification de nouveaux composés actifs à partir de micro-organismes négligés, renforce également l'équilibre du pôle d'excellence Microverse, qui étudie la formation et l'équilibre des communautés microbiennes, grâce à ce projet. Les bactéries anaérobies y ont jusqu'à présent joué un rôle secondaire, notamment parce qu'elles étaient difficiles d'accès d'un point de vue méthodologique. Le chercheur souhaite à présent combler cette lacune.
La subvention avancée du CER, l'une des plus prestigieuses de l'Union européenne, récompense l'excellence et l'innovation des meilleurs chercheurs. Le projet "AnoxyGen" de Christian Hertweck a été sélectionné en raison de ses grandes perspectives d'élargissement de notre compréhension de la biosynthèse microbienne et de développement de nouvelles applications biotechnologiques. Avec des moyens financiers confortables, le chercheur et son équipe interdisciplinaire s'attaqueront à ce sujet au cours des cinq prochaines années.
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