Der dichteste nicht-aminoglykosidische Ligand für die bakterielle ribosomale RNA A-Site
Eine Forschungsgruppe der Tohoku University hat eine signifikante Entdeckung mit positiven Auswirkungen auf die Entwicklung von Medikamenten zur Bakterienbekämpfung gemacht. Die Aminoacyl-tRNA-Site (A-Site) der 16S-RNA-Dekodierungsregion im bakteriellen Ribosom verspricht eine neue Ära der Entwicklung von Antibiotika.
Chemische Struktur von ATMND-C2-NH2 und Sequenz des in dieser Studie verwendeten bakteriellen (Escherichia coli) A-site-haltigen RNA-Modells. Es zeigt auch die mögliche Struktur des Komplexes zwischen ATMND-C2-NH2 (grüne Farbe) und der internen Schleife der A-Stelle.
Seiichi Nishizawa
Herkömmliche Aminoglykosid-Antibiotika sind aufgrund ihrer hohen Toxizität und des Potenzials zur Resistenzentwicklung problematisch. Die Forschung an der Tohoku University konzentrierte sich auf bakterielle A-Site bindende kleine Liganden, deren Strukturen sich von denen der Aminoglykosidfamilie unterscheiden, die Potenzial für die Entwicklung neuartiger Medikamente zur Behandlung bakterieller Infektionen mit einer Verringerung der Probleme im Zusammenhang mit traditionellen Antibiotika bieten.
Die Forschungsgruppe unter der Leitung von Dr. Seiichi Nishizawa und Dr. Yusuke Sato (Department of Chemistry, Graduate School of Science) hat einen neuartigen kleinen Liganden, ATMND-C2-NH2, gemeldet, der die höchste Bindungsaffinität für die bakterielle A-Stelle unter den Nicht-Aminoglykosidliganden aufweist.
ATMND-C2-NH2 zeigt eine signifikante fluoreszierende Abschreckreaktion bei selektiver Bindung an die innere Schleife der bakteriellen (Escherichia coli) A-site-haltigen Modell-RNA. ATMND-C2-NH2 hat sich auch als Indikator für die Beurteilung von Ligand-/Art-Interaktionen bewährt.
Die Ergebnisse der Forschungsgruppe bieten eine rationale Grundlage für die Entwicklung neuartiger A-Site-Bindungsliganden im Hinblick auf neuartige Antibiotika mit geringerer Toxizität und minimaler Resistenzentwicklung.
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