SARS-CoV-2: Os dados do telemóvel e do genoma permitem o rastreio orientado das vias de infeção
Cientistas da start-up nanozoo GmbH de Jena e do Hospital Universitário de Jena apresentam uma análise
Para rastrear a propagação de agentes patogénicos como o SARS-CoV-2 de uma forma mais direcionada, é possível combinar dados anónimos de telemóveis e outros metadados (como códigos postais) com dados do genoma. Uma análise sistemática destes conjuntos de dados combinados foi agora apresentada por cientistas da empresa start-up nanozoo GmbH, sediada em Jena, e do Hospital Universitário de Jena (UKJ) - ambos parceiros do Campus de Investigação InfectoGnostics de Jena. A equipa publicou os resultados do estudo sob o título "Leveraging mobility data to analyse persistent SARS-CoV-2 mutations and inform targeted genomic surveillance" na revista de acesso livre eLife.
Sequenciação do genoma por Nanopore por funcionários do Instituto de Medicina da Infeção e Higiene Hospitalar do Hospital Universitário de Jena.
Michael Szabó/UKJ
A pandemia de SARS-CoV-2 demonstrou a importância do rastreio precoce dos surtos e das vias de infeção. No entanto, a monitorização eficaz do processo de infeção exige uma análise de dados precisa e eficiente em termos de recursos, que conduza efetivamente a previsões fiáveis. O estudante de doutoramento do UKJ, Riccardo Spott, juntamente com outros investigadores do InfectoGnostics do UKJ e da nanozoo, conseguiu agora demonstrar que os dados dos serviços de telefonia móvel, em combinação com metadados de alta resolução (como códigos postais e dados do genoma), podem efetivamente melhorar a monitorização da incidência de infecções no estado alemão da Turíngia. No caso de surtos de doenças, essa análise de dados poderá ser utilizada no futuro para testes e quarentena mais direcionados.
Na sua avaliação, os investigadores certificaram-se de que os dados eram processados de forma anónima, como explica o Dr. Christian Brandt, investigador do UKJ e cofundador da nanozoo: "Recebemos os dados dos telemóveis como conjuntos de dados agregados, combinámo-los com dados de sequências e analisámo-los para detetar padrões de distribuição evidentes. É como olhar para um rasto de formigas a partir de cima: Consegue-se ver a totalidade dos movimentos, mas não se consegue distinguir uma única formiga."
No estudo, mais de 6.500 genomas alfa do SARS-CoV-2 (B.1.1.7) foram sequenciados na Turíngia durante um período de nove meses. Os dados foram complementados com dados de isolamento dos doentes e dos seus códigos postais. Além disso, foram incluídos na análise mais de 136.000 genomas alfa alemães publicamente disponíveis e dados de serviços de telemóveis da Turíngia. A equipa identificou nove variantes de mutação relevantes do vírus na Turíngia, que foram categorizadas em sete grupos de parentesco distintos (clusters filogenéticos) com diferentes padrões de propagação na Turíngia.
Utilização de dados de telemóveis para uma melhor amostragem
Ao associar desta forma os dados relativos ao genoma e aos telemóveis, os cientistas puderam traçar com precisão a propagação da linhagem alfa do coronavírus na Turíngia. O risco de distorção dos dados epidemiológicos foi também demonstrado com base numa mutação específica - um fator que pode ser utilizado para otimizar futuras avaliações. Além disso, esta abordagem também permite testes mais direcionados: com dados adicionais de uma sub-linha Omikron (BQ.1.1), os parceiros da InfectoGnostics conseguiram demonstrar que estas análises também podem ser utilizadas para controlar ativamente a amostragem durante surtos regionais de uma doença infecciosa. Um estado federal como a Turíngia poderia assim monitorizar futuras epidemias de forma mais eficiente.
O Prof. Dr. Mathias Pletz, Diretor do Instituto de Medicina da Infeção e Higiene Hospitalar do Hospital Universitário de Jena e membro do conselho alargado da InfectoGnostics, explica: "A propagação de vírus segue frequentemente os caminhos da mobilidade humana. Com dados anónimos de telemóveis e técnicas moleculares avançadas, somos capazes de mapear e prever esses caminhos". Segundo Pletz, isto contribui significativamente para prever com maior precisão a propagação espacial de um agente patogénico - que pode variar muito entre regiões - e para utilizar testes e medidas de controlo de infecções mais direcionados.
Observação: Este artigo foi traduzido usando um sistema de computador sem intervenção humana. A LUMITOS oferece essas traduções automáticas para apresentar uma gama mais ampla de notícias atuais. Como este artigo foi traduzido com tradução automática, é possível que contenha erros de vocabulário, sintaxe ou gramática. O artigo original em Alemão pode ser encontrado aqui.
Publicação original
Riccardo Spott, Mathias W Pletz, Carolin Fleischmann-Struzek, Aurelia Kimmig, Christiane Hadlich, Matthias Hauert, Mara Lohde, Mateusz Jundzill, Mike Marquet, Petra Dickmann, Ruben Schüchner, Martin Hölzer, Denise Kühnert, Christian Brandt; "Leveraging mobility data to analyze persistent SARS-CoV-2 mutations and inform targeted genomic surveillance"; eLife, Volume 13, 2025-1-15
Outras notícias do departamento ciência
Notícias mais lidas
Mais notícias de nossos outros portais
Algo está acontecendo no setor de ciências biológicas...
É assim que se parece o verdadeiro espírito pioneiro: Muitas start-ups inovadoras estão trazendo ideias novas, força vital e espírito empreendedor para mudar o mundo de amanhã para melhor. Mergulhe no mundo dessas jovens empresas e aproveite a oportunidade para entrar em contato com os fundadores.