les "gènes sauteurs" soutiennent les cellules immunitaires dans les tissus
Des chercheurs de l'Institut Leibniz d'immunothérapie (LIT) décrivent un nouveau type de régulation des cellules immunitaires par ce que l'on appelle les "gènes sauteurs
LIT
Des chercheurs de la division d'immunologie du LIT ont procédé à un examen épigénétique de l'ADN de cellules immunitaires résidant dans les tissus de différents organes. L'épigénétique décrit comment les gènes peuvent être activés et désactivés comme un interrupteur pour que les cellules se développent différemment. Un aspect important de l'épigénétique est la régulation de ce que l'on appelle les enhancers, des segments d'ADN accessibles qui influencent l'expression des gènes. "De manière surprenante, nous avons trouvé des programmes d'adaptation remarquablement similaires contrôlés par l'épigénétique dans différents types de cellules immunitaires dans les tissus. Cette constatation suggère l'existence de mécanismes de régulation génétique de niveau supérieur", explique le Dr Philipp Stüve, l'un des premiers auteurs de l'étude.
"À la recherche de ces mécanismes de régulation génique de haut niveau, nous avons découvert un enrichissement de transposons ou de gènes sauteurs dans des régions d'ADN accessibles sur le plan épigénétique", explique le Dr Lisa Schmidleithner, l'un des premiers auteurs de l'étude.
Les gènes sauteurs ont été incorporés dans le génome à partir de virus et ont laissé des milliers de copies à différents endroits du génome au cours de l'évolution grâce à une intégration spontanée dans le génome ("saut"). En conséquence, ils représentent aujourd'hui près de 50 % de l'ADN humain. Pendant longtemps, on a pensé que ces gènes sauteurs n'avaient aucune fonction. Même si la plupart des gènes sauteurs ne sont plus mobiles aujourd'hui, des études récentes ont montré qu'ils jouent un rôle important dans la régulation des gènes. "Nos données montrent un enrichissement de certaines familles de gènes sauteurs dans les cellules immunitaires résidant dans les tissus, dans des régions d'enhancers accessibles, ce qui pourrait réguler l'adaptation des cellules immunitaires aux tissus. En outre, ces gènes sauteurs présentent des motifs pour les sites de liaison des facteurs de transcription, qui sont importants pour la fonction des enhancers", explique le Dr Malte Simon, l'un des premiers auteurs de l'étude. Ainsi, les gènes sauteurs représentent un type de régulation génétique jusqu'ici sous-estimé qui pourrait expliquer les programmes adaptatifs communs que subissent les différentes cellules immunitaires au cours de leur développement, du sang jusqu'aux cellules immunitaires fonctionnelles résidentes dans les tissus. D'autres recherches sont maintenant nécessaires pour mieux comprendre ce nouveau domaine de l'immunologie tissulaire.
"Une compréhension globale du système immunitaire dans les tissus est une condition préalable aux approches thérapeutiques spécifiques aux tissus afin de traiter l'inflammation ou les maladies tumorales à l'aide de cellules immunitaires génétiquement améliorées", explique le professeur Markus Feuerer, auteur principal de l'étude.
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Publication originale
Malte Simon, Philipp Stüve, Lisa Schmidleithner, Sebastian Bittner, Niklas Beumer, Nicholas Strieder, Christian Schmidl, Asmita Pant, Claudia Gebhard, Andreas Eigenberger, Michael Rehli, Lukas Prantl, Thomas Hehlgans, Benedikt Brors, Charles D. Imbusch, Michael Delacher, Markus Feuerer; "Single-cell chromatin accessibility and transposable element landscapes reveal shared features of tissue-residing immune cells"; Immunity