La séquence du génome de la myrtille de l'ombre décryptée
Une équipe de recherche étudie le patrimoine génétique complexe de la variété de cerises acides à l'aide de nouvelles technologies et en déduit l'origine de l'espèce fruitière
Les cerises acides (Prunus cerasus L.) ont un très grand génome (tétraploïde). Cela s'explique par le fait que les génomes des parents se sont combinés au cours de l'évolution, c'est-à-dire lors du passage des ancêtres sauvages aux variétés actuelles. Jusqu'à présent, la taille et la complexité du génome rendaient difficile le décodage de la séquence génétique complète de certaines variétés. Un groupe de recherche de l'Institut Julius Kühn (JKI) à Dresde, de l'Université de Greifswald et de l'entreprise néerlandaise KeyGene y est parvenu pour la variété "Schattenmorelle". Dans "Frontiers in Plant Science", les chercheurs décrivent comment ils ont décrypté les éléments constitutifs du très grand patrimoine génétique à l'aide d'une nouvelle technologie permettant de générer de longues séquences d'ADN et d'astuces bioinformatiques. Avec la séquence du génome de la griotte de l'ombre, on dispose désormais de toutes les données génétiques importantes pour tirer des conclusions sur l'origine des cerises acides.
"Les cerises acides sont apparues dans les régions de la mer Caspienne et de la mer Noire par le croisement naturel de deux espèces parentales, la cerise des steppes (Prunus fruticosa Pall.) et la cerise douce (P. avium L.)", rapporte le Dr Thomas Wöhner du JKI à Dresde-Pillnitz. Selon lui, le moment et le lieu exacts de cet "accouplement spontané" ainsi que les conséquences sur la structure du génome ne sont pas encore totalement élucidés. "Ce qui est certain, c'est que les deux espèces parentales se sont d'abord développées séparément. Ensuite, des hybridations ont dû se produire par hasard dans des régions où elles étaient présentes en même temps, ce qui a finalement donné naissance aux cerises acides actuelles", explique le chercheur en sélection. Comme le confirme la séquence décryptée du génome de la griotte, le génome de la griotte est donc composé de deux parties. Une moitié des chromosomes provient de la cerise douce et l'autre de la cerise des steppes.
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Publication originale
Thomas W. Wöhner, Ofere F. Emeriewen, Alexander H. J. Wittenberg, Koen Nijbroek, Rui Peng Wang, Evert-Jan Blom, Harrie Schneiders, Jens Keilwagen, Thomas Berner, Katharina J. Hoff, Lars Gabriel, et al.; "The structure of the tetraploid sour cherry ‘Schattenmorelle’ (Prunus cerasus L.) genome reveals insights into its segmental allopolyploid nature"; Frontiers in Plant Science, Volume 14, 2023-12-1
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