Un nouveau ribozyme peut rendre les molécules d'ARN accessibles à la chimie click dans les cellules vivantes
Des progrès importants pour la recherche sur l'ARN
Les molécules d'ARN sont de véritables outils à tout faire. Elles transfèrent l'information génétique de l'ADN dans la cellule. Elles régulent l'activité des gènes. Et certaines d'entre elles ont un effet catalytique : tout comme les enzymes, elles permettent des réactions biochimiques qui seraient difficiles ou impossibles à réaliser par elles-mêmes. Ces molécules d'ARN spéciales qui accélèrent de telles réactions sont appelées ribozymes.
L'équipe de Claudia Höbartner, professeur de chimie à l'université Julius-Maximilians (JMU) de Würzburg, présente aujourd'hui dans la revue Nature Chemistry un ribozyme nouvellement découvert appelé SAMURI.
SAMURI peut modifier avec précision d'autres molécules d'ARN. Cette capacité est très utile pour la recherche sur l'ARN : "Nous pouvons utiliser ces ribozymes comme outils pour marquer l'ARN avec des colorants et le rendre visible", explique le Dr Takumi Okuda, chercheur à l'université JMU. "De cette manière, les voies de l'ARN dans la cellule et ses interactions avec d'autres molécules peuvent être encore mieux étudiées."
Les ribozymes pourraient également faire l'objet d'une utilisation thérapeutique à l'avenir. "Nous voyons de nouvelles applications possibles pour les ribozymes lorsque les enzymes responsables d'une tâche spécifique manquent ou ne sont plus fonctionnelles en raison de mutations", explique Claudia Höbartner.
Détails sur le nouveau ribozyme
Qu'est-ce qui distingue le nouveau ribozyme SAMURI ? Il modifie d'autres molécules d'ARN au niveau d'un site précisément défini d'une adénine spécifique. Il y fixe des molécules auxquelles des colorants ou d'autres molécules peuvent être facilement attachés, comme on attache une ceinture de sécurité. De telles réactions sont connues sous le nom de "click chemistry".
SAMURI présente également l'avantage d'être actif dans les mêmes conditions physiologiques que celles qui prévalent dans les cellules vivantes. Ce n'est pas le cas des autres ribozymes synthétiques.
Autre particularité : SAMURI utilise un nouveau cofacteur synthétique pour rendre les molécules d'ARN accessibles à la chimie click. Ce cofacteur a été mis au point par le Dr Takumi Okuda ; il s'inspire du cofacteur naturel omniprésent SAM (S-adénosylméthionine). C'est également de là que vient le nom de la nouvelle ribozyme : SAMURI signifie "SAM-analogue utilising ribozyme".
Les étapes suivantes de la recherche
Le groupe de Claudia Höbartner souhaite maintenant élucider la structure et le mécanisme d'action de SAMURI. Elle souhaite également développer d'autres ribozymes capables de modifier les blocs de construction de l'ARN autres que l'adénine.
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