Les chercheurs découvrent un "point faible" dans les principaux variants de COVID-19.
"Cette étude révèle un point faible qui est largement inchangé à travers les variantes et qui peut être neutralisé par un fragment d'anticorps".
Des chercheurs de l'Université de la Colombie-Britannique ont découvert une vulnérabilité clé dans tous les principaux variants du virus SRAS-CoV-2, y compris les sous-variants BA.1 et BA.2 Omicron récemment apparus.
La microscopie cryo-électronique révèle comment le fragment d'anticorps VH Ab6 (rouge) se fixe au site vulnérable de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 (gris) pour empêcher le virus de se lier au récepteur cellulaire humain ACE2 (bleu).
Dr. Sriram Subramaniam, UBC
Cette faiblesse peut être ciblée par des anticorps neutralisants, ce qui pourrait ouvrir la voie à des traitements qui seraient universellement efficaces pour toutes les variantes.
Les résultats, publiés dans Nature Communications, utilisent la cryo-microscopie électronique (cryo-EM) pour révéler la structure au niveau atomique du point vulnérable de la protéine de pointe du virus, appelé épitope. L'article décrit également un fragment d'anticorps appelé VH Ab6, capable de se fixer sur ce site et de neutraliser chaque variante majeure.
"Il s'agit d'un virus hautement adaptable qui a évolué pour échapper à la plupart des traitements par anticorps existants, ainsi qu'à une grande partie de l'immunité conférée par les vaccins et les infections naturelles", explique le Dr Sriram Subramaniam(he/him), professeur à la faculté de médecine de l'UBC et auteur principal de l'étude. "Cette étude révèle un point faible qui reste largement inchangé d'une variante à l'autre et qui peut être neutralisé par un fragment d'anticorps. Elle ouvre la voie à la conception de traitements pan-variants qui pourraient potentiellement aider un grand nombre de personnes vulnérables."
Identifier les clés maîtresses du COVID-19
Les anticorps sont naturellement produits par notre organisme pour combattre les infections, mais ils peuvent aussi être fabriqués en laboratoire et administrés aux patients en tant que traitement. Si plusieurs traitements par anticorps ont été développés pour le COVID-19, leur efficacité s'est émoussée face à des variantes hautement mutées comme Omicron.
"Les anticorps s'attachent à un virus d'une manière très spécifique, comme une clé qui entre dans une serrure. Mais lorsque le virus mute, la clé ne convient plus", explique le Dr Subramaniam. "Nous avons cherché des clés maîtresses - des anticorps qui continuent à neutraliser le virus même après des mutations importantes."
La "clé maîtresse" identifiée dans ce nouvel article est le fragment d'anticorps VH Ab6, qui s'est révélé efficace contre les variantes Alpha, Beta, Gamma, Delta, Kappa, Epsilon et Omicron. Le fragment neutralise le SRAS-CoV-2 en se fixant à l'épitope de la protéine spike et en empêchant le virus de pénétrer dans les cellules humaines.
Cette découverte est le fruit d'une collaboration fructueuse et de longue date entre l'équipe du Dr Subramaniam à l'UBC et ses collègues de l'Université de Pittsburgh, dirigée par les Drs Mitko Dimitrov et Wei Li. L'équipe de Pittsburgh a criblé de grandes bibliothèques d'anticorps et testé leur efficacité contre COVID-19, tandis que l'équipe de l'UBC a utilisé la cryo-EM pour étudier la structure moléculaire et les caractéristiques de la protéine de pointe.
Concentration sur les points faibles de COVID-19
L'équipe de l'UBC est mondialement connue pour son expertise dans l'utilisation de la cryo-EM pour visualiser les interactions protéine-protéine et protéine-anticorps à une résolution atomique. Dans un autre article publié plus tôt cette année dans Science, ils ont été les premiers à rapporter la structure de la zone de contact entre la protéine spike d'Omicron et le récepteur cellulaire humain ACE2, fournissant ainsi une explication moléculaire de la capacité virale accrue d'Omicron.
En cartographiant la structure moléculaire de chaque protéine de pointe, l'équipe a recherché des zones de vulnérabilité qui pourraient donner lieu à de nouveaux traitements.
"L'épitope que nous décrivons dans cet article est en grande partie éloigné des points chauds des mutations, ce qui explique pourquoi ses capacités sont préservées entre les variantes", explique le Dr Subramaniam. "Maintenant que nous avons décrit la structure de ce site en détail, cela ouvre un tout nouveau domaine de possibilités de traitement."
Selon le Dr Subramaniam, cette vulnérabilité clé peut désormais être exploitée par les fabricants de médicaments, et comme le site est relativement exempt de mutation, les traitements qui en résultent pourraient être efficaces contre les variantes existantes, voire futures.
"Nous avons maintenant une image très claire de ce point vulnérable du virus. Nous connaissons toutes les interactions entre la protéine spike et l'anticorps à cet endroit. Nous pouvons travailler à rebours à partir de cela, en utilisant la conception intelligente, pour développer une série de traitements par anticorps", déclare le Dr Subramaniam. "Disposer de traitements largement efficaces et résistants aux variantes changerait la donne dans la lutte actuelle contre le COVID-19."
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
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