Pescar ADN para medir la biodiversidad

Identificar las especies de peces presentes en un río a partir de restos de su ADN: este método se ha probado con éxito en unos 90 lugares de Suiza

07.12.2023
© Altermatt lab/Eawag

Al nadar, los peces dejan fragmentos de ADN tras de sí.

Al nadar, los peces dejan tras de sí fragmentos de ADN, por ejemplo, a través de su piel o sus excrementos. Una vez recogidos y analizados, estos indicadores permiten a los científicos determinar todas las especies presentes en el medio. Además, el método es preciso, más sencillo y menos dañino para los peces que la electropesca generalmente utilizada para este fin. Esta es la conclusión de un estudio a gran escala financiado conjuntamente por la Fundación Nacional Suiza para la Ciencia (FNS) y la Oficina Federal de Medio Ambiente (FOEN). Los resultados del estudio se han publicado recientemente en el Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences.

"Detectives científicos" de los ríos

El estudio ha sido dirigido por Florian Altermatt, catedrático de Ecología Acuática de la Universidad de Zúrich y jefe de un laboratorio de la Eawag. Según explica: "en el pasado, el inventario de la biodiversidad en los ríos sólo se ha hecho esporádicamente, cada cinco años aproximadamente, lo que no es suficiente para hacer un seguimiento adecuado de la biodiversidad". Además, los inventarios se han basado únicamente en la identificación morfológica de los ejemplares, generalmente obtenida mediante la pesca con electrobombas. Este método, autorizado en Suiza únicamente con fines científicos, consiste en atraer a los peces a la superficie y aturdirlos con una corriente eléctrica.

Los científicos buscan ahora nuevos métodos para medir la biodiversidad acuática que sean más fáciles de utilizar y más éticos, y el grupo de Altermatt centra sus esfuerzos en el ADN ambiental.

Por "ADN ambiental" se entienden los fragmentos de ADN que los organismos dejan tras de sí. Una vez capturados y analizados con herramientas genéticas, permiten identificar la especie a la que pertenecen. "Estos fragmentos delatan la presencia de determinadas especies en una zona concreta -o cercana a ella, por ejemplo, aguas arriba del lugar examinado-. Es un poco como el ADN que puede encontrarse en la escena de un crimen", explica el profesor.

Unos 90 yacimientos estudiados en Suiza

La técnica se ha empleado en Suiza a escala de todos los ríos, lo que ofrece una perspectiva a muy gran escala. Florian Altermatt y su equipo han examinado 89 ríos de toda Suiza.

En cada uno de estos lugares, los científicos recogieron dos litros de agua del río y extrajeron de ella el ADN ambiental. Comparando el ADN extraído con un gran volumen de datos sobre secuencias de ADN de peces -un almacén casi exhaustivo de perfiles de ADN- pudieron identificar las especies a las que pertenecían las secuencias encontradas en el agua. Para evaluar la precisión del método, compararon la lista de especies identificadas con la lista completa de especies que probablemente se encontrarían en el lugar, basada en datos históricos recogidos a lo largo de 30 años. En dos tercios de los lugares, el método también se comparó con la técnica de la electropesca.

La conclusión: el ADN ambiental es un método fiable para estimar la biodiversidad en los ríos. Los resultados coinciden con los datos históricos, y el método permite detectar una mayor diversidad de especies que una sola prueba de electropesca. "Con el ADN ambiental también pudimos identificar especies que viven aguas arriba del lugar de muestreo o especies difíciles de capturar con la electropesca", afirma el investigador.

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Publicación original

J. Brantschen and F. Altermatt: Contrasting strengths of eDNA and electrofishing compared to historic records for assessing fish community diversity and composition. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences (2023)

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