Un estudio exhaustivo descubre que las mutaciones en el genoma no codificante son conductores poco frecuentes del cáncer
Ha surgido una imagen más clara de cómo los cambios en el ADN conducen al cáncer, tras la evaluación más exhaustiva de las mutaciones conductoras no codificantes realizada hasta la fecha por los investigadores del Instituto Wellcome Sanger, el Instituto Broad del MIT y el Hospital General de Harvard, Massachusetts (MGH), el Hospital Universitario de Aarhus y sus colaboradores.
El estudio, publicado en Nature como parte de un proyecto global de Pan-Cancer, descubrió varios nuevos impulsores de cáncer en genes no codificantes. Sin embargo, la conclusión general reafirma que la gran mayoría de los factores de riesgo de cáncer se producen en las regiones del genoma humano que codifican las proteínas. Este conocimiento ayudará a centrar los esfuerzos en el descubrimiento de nuevas causas y tratamientos para el cáncer.
También se han publicado en Nature y en revistas relacionadas, 22 estudios más del Proyecto Pan-Cancer. El proyecto representa una exploración internacional sin precedentes de 2.600 genomas de cáncer, lo que mejora significativamente nuestra comprensión fundamental del cáncer y pone a cero los mecanismos de desarrollo del cáncer.
Las mutaciones conductoras son cambios en el ADN que "conducen" a las células hacia el cáncer. Dependiendo del tipo de cáncer, se requieren entre una y diez mutaciones conductoras para que se desarrolle el cáncer.
La mayoría de los estudios genómicos a gran escala sobre el cáncer hasta la fecha se han centrado en la detección de las mutaciones conductoras en los genes que codifican las proteínas. Dado que estas secuencias codificantes representan menos del 2% del genoma humano, en los últimos años se ha investigado el 98% restante del genoma "no codificante". En 2013, se descubrieron mutaciones conductoras en el gen TERT no codificante en muchos tipos de cáncer, lo que aumenta la posibilidad de que haya numerosas mutaciones conductoras no codificantes en la "materia oscura" del genoma.
Este estudio es la evaluación más exhaustiva hasta la fecha del alcance de las mutaciones conductoras no codificantes del cáncer, en cuanto al número de métodos empleados, el número de muestras analizadas y el número de tipos de cáncer, región del genoma y mutaciones estudiadas. En total, se analizaron 2.600 genomas de 38 tipos de tumores diferentes.
El equipo identificó una serie de nuevas mutaciones cancerígenas no codificantes, como las mutaciones no codificantes en la región no traducida de 5' del gen TP53, que están asociadas con que este gen se exprese con menos fuerza, o se "apague".
Sin embargo, los resultados concluyeron que las mutaciones en las secuencias reguladoras que rodean a los genes del cáncer son relativamente raras. Excluyendo las mutaciones en el gen TERT, el número de mutaciones conductoras no codificantes identificadas equivalía a alrededor de una (o menos) de cada 100 tumores. En comparación, las regiones que codifican las proteínas suelen albergar varias mutaciones conductoras por tumor. Se descubrió que algunos factores impulsores no codificantes identificados en estudios anteriores eran el resultado de metodologías menos precisas o el resultado de procesos de hipermutación no caracterizados anteriormente.
El Dr. Federico Abascal, del Instituto Wellcome Sanger, dijo: "El hecho de que nuestros resultados contrasten tanto con otros estudios se debe en gran medida a lo riguroso que ha sido nuestro análisis. A pesar de utilizar numerosos métodos, el mayor conjunto de datos actualmente disponible y de estudiar una amplia gama de regiones no codificantes del genoma, encontramos muy pocas mutaciones conductoras genuinas fuera de los genes que codifican las proteínas".
El Dr. Gad Getz, del Instituto Broad y MGH, dijo: "Las mutaciones conductoras no codificantes que hemos identificado, como en el gen TP53, se suman a la corta lista de mutaciones conductoras no codificantes que ya incluye TERT, FOXA1 y algunos otros genes. Analizando rigurosamente los mecanismos que contribuyen al aumento de las tasas de mutación, no sólo pudimos encontrar nuevos impulsores, sino que también planteamos dudas sobre los anteriormente comunicados que se ven afectados por los procesos de mutación locales y los artefactos descubiertos en nuestro estudio. Esperamos que nuestro análisis sirva de base para futuros estudios del genoma del cáncer".
Este resultado inesperado tiene importantes implicaciones para el tratamiento del cáncer. Si bien los avances tecnológicos y las cohortes más grandes conducirán indudablemente al descubrimiento de más mutaciones de los conductores no codificantes, es poco probable que la relación entre los conductores codificantes y los no codificantes cambie de manera significativa. Esto implica que los esfuerzos para desarrollar nuevos tratamientos contra el cáncer deben centrarse principalmente en los genes que codifican las proteínas.
El Dr. Inigo Martincorena, del Instituto Wellcome Sanger, dijo: "En general, nuestro estudio sugiere que, si bien los conjuntos de datos cada vez más grandes continuarán produciendo nuevas mutaciones codificadoras y no codificadoras, la gran mayoría de las mutaciones cancerígenas se producen en el 2% del genoma que codifica para las proteínas. Para nosotros, este fue un resultado inesperado e importante. Para los pacientes de cáncer, esto significa que la gran mayoría de las mutaciones clínicamente relevantes en un cáncer es probable que se encuentren en secuencias de codificación de proteínas, lo que simplificará los esfuerzos para el uso clínico de la secuenciación del genoma en el cáncer".
Nota: Este artículo ha sido traducido utilizando un sistema informático sin intervención humana. LUMITOS ofrece estas traducciones automáticas para presentar una gama más amplia de noticias de actualidad. Como este artículo ha sido traducido con traducción automática, es posible que contenga errores de vocabulario, sintaxis o gramática. El artículo original en Inglés se puede encontrar aquí.
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