Verbesserte Methode bei Untersuchungen zur Proteinexpression
Neuer RZPD-Service für die funktionelle Genomanalyse
Berlin. Das RZPD Deutsches Ressourcenzentrum für Genomforschung GmbH ist der weltweit erste Anbieter eines Services zur Erstellung von Protein-Expressionsprofilen mit Hilfe spezieller Antikörper-Chips. Die Biochips erlauben es, wichtige Einblicke in den Verlauf von zum Beispiel Krebs oder Herz- und Kreislauferkrankungen zu erhalten. Dazu wird die Proteinexpression von gesundem und erkranktem Gewebe direkt verglichen. Neben den diagnostischen Anwendungen eröffnen die Chips die Möglichkeit, entwicklungsrelevante Proteine zu identifizieren, toxikologische Studien durchzuführen (Wirkung von chemischen Substanzen, wie zum Beispiel zu testenden Medikamenten, auf die Genaktivität) oder den Einfluß von Umweltfaktoren auf das Proteinmuster von Zellen zu bestimmen.
Diese Methode ist eine wichtige Weiterentwicklung bei der funktionellen Genomanalyse, denn sie erlaubt es, den tatsächlichen Proteingehalt in einer Zelle zu einem gegebenen Zeitpunkt zu bestimmen. Die bislang gängige "Transcriptomics-Methode", bei der RNA-Menge beziehungsweise die Änderung des RNA-Levels eines Gens bestimmt wird, reflektiert nicht immer die Zusammensetzung des Proteoms einer Zelle. Außerdem sind posttranslationale Modifikationen der Proteine (Phosphorylierungen, Glykosylierungen etc.), die für regulatorische Prozesse in der Zelle sehr wichtig sind, auf der Transkriptom-Ebene nicht detektierbar.
Bei der jetzt vom RZPD eingesetzten neuen Chip-Technologie werden Antikörper, die vorher mit verschiedenen immunologischen Methoden validiert wurden, auf Glasoberflächen oder andere Matrices gespottet. Die immobilisierten Antikörper binden ihr spezifisches Antigen, das zuvor fluoreszenzmarkiert wurde. Die Detektion erfolgt über die quantitative Messung der Fluoreszenz (analog zu Gen-Chips).
Das RZPD arbeitet mit BD Antikörper-Chips (512 Ab) des Unternehmens Becton Dickinson Bioscience und etabliert derzeit weitere Assays. Somit ist das RZPD in der Lage, auf die unterschiedlichen Bedürfnisse externer Partner beim Protein-Profiling flexibel und breitgefächert einzugehen.
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