Weiterer Ausbau des RZPD Affymetrix-Service: Schnellere Detektion genetischer Varianten beim Menschen
Das RZPD Deutsches Ressourcenzentrum für Genomforschung GmbH weitet seine Dienstleistungen rund um die GeneChip®-Technologie des Microarray-Weltmarkführers Affymetrix weiter aus. Im Rahmen des in Europa von nur wenigen exklusiven Service-Anbietern verfügbaren Affymetrix-Screening-Services (www.rzpd.de/services/affymetrix) bietet das RZPD seit kurzem die Analyse des Human Mapping 10K Array an (Full Service, Core Service).
Diese neuartige Array-Technologie für die Detektion von Einzelnukleotid-Varianten (SNPs) ermöglicht das parallele Screening von mehr als 11.500 SNPs auf einem einzigen Chip (Human Mapping 10K Array). Genom-Scans können so innerhalb von nur einer Woche durchgeführt werden, es werden lediglich geringe Mengen Ausgangsmaterial gebraucht (250 ng genomische DNA), und der Anwender erhält wesentlich mehr genetische Informationen im Vergleich zu beispielsweise gängigen Mikrosatelliten-Analysen.
Die Anwendungsfelder der SNP-Array-Technologie sind vielfältig. So kann sie für Kopplungs- und Assoziationsanalysen für die Identifizierung von krankheitsassoziierten Genen oder für sogenannte "loss-of-heterozygosity"(LOH)-Studien für die Lokalisation von krankheitsauslösenden Veränderungen des Erbmaterials (die beispielsweise Krebs auslösen können) eingesetzt werden. Solche Analysen sind mit der SNP-Array-Technologie wesentlich schneller und kostengünstiger möglich als mit herkömmlichen Techniken.
Das RZPD bietet außerdem im Rahmen der seit 2001 bestehenden Kooperation mit Affymetrix die Analyse aller Affymetrix Katalog- und Custom GeneChips® für Genexpressionsanalysen bei eukaryotischen und prokaryotischen Organismen an. Das Angebot wird durch weitere Dienstleistungen rund um die Probenaufbereitung, Datenintegration sowie durch Expressionsstudien auf Proteinebene ergänzt.
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