GATC Biotech AG und MPI für Molekulare Genetik kooperieren bei sicherer Analyse von DNA- und Proteindaten

GATC ermöglicht verschlüsselten Zugang zu hochwertigen Datenbanken

25.09.2003

GATC Biotech AG, ein führender europäischer Provider für molekularbiologische Dienstleistungen und Software, und das Max-Planck-Institut für Molekulare Genetik, Berlin, kooperieren im Bereich der bioinformatischen Analyse von Expressed Sequence Tags (ESTs) und Protein-Sequenzen. Dies erlaubt den Kunden der GATC Biotech AG die vertrauliche Analyse ihrer EST-Daten mit Rückschlüssen auf genomische Struktur, Transkripte und deren Splicevarianten, sowie Gewebespezifität und Proteinfunktion.

GATC Biotech AG stellt hinter der firmeneigenen Firewall die Datenbanken GeneNest, SpliceNest und SYSTERS3 zur Verfügung. GeneNest stellt geclusterte cDNA-Sequenzen zur Recherche bereit. SpliceNest visualisiert die Exon-Intron-Struktur der GeneNest-Konsensussequenzen auf dem Genom und hebt potentielle Splicevarianten hervor. SYSTERS3 umfasst sämtliche Proteinsequenzen gruppiert in Familien und Superfamilien. Die Datenbanken sind in einem bequemen Browser-Interface miteinander verknüpft und ermöglichen Recherchen von der genomischen Organisation über die mRNA bis hin zur Proteinsequenz und deren Funktion.

Prof. Martin Vingron, Direktor der Abteilung Bioinformatik des MPI für Molekulare Genetik, zeigt sich sehr zufrieden über die Möglichkeiten, welche die Kooperation bietet: "Durch die Etablierung der Datenbanken GeneNest, SpliceNest und SYSTER3 bei GATC Biotech AG stehen diese nun einer großen Anzahl von Nutzern aus der Industrie zur Verfügung."

Peter Pohl, CEO der GATC Biotech AG: "GATC ist durch diese Kooperation in der Lage, seinen Kunden für sensible Daten neben der bereits etablierten sicheren Bereitstellung öffentlicher Datenbanken wie NCBI Zugriffsmöglichkeiten auf hochwertige Datenbanken zu gewährleisten. Es ist ein weiterer wichtiger Baustein in unserem Portfolio, der es uns ermöglicht, unseren Kunden umfassende Genomics Services aus einer Hand anzubieten."

https://www.bionity.com/de/news/29047/gatc-biotech-ag-und-mpi-fuer-molekulare-genetik-kooperieren-bei-sicherer-analyse-von-dna-und-proteindaten.html