Siphoviridae

Die Virusfamilie Siphoviridae (gr. σίφων siphon: Wasserröhre) umfasst Bakteriophagen der Ordnung Caudovirales mit einem linearen, doppelsträngigen DNA-Genom von ca. 22-121 kBp Länge und einem 50-60 nm im Durchmesser großen ikosaedrisches Kapsid mit einem 56-570 nm langen, nicht-kontraktilen Schwanzteil. Dieses Schwanzteil besteht aus übereinander gestapelten Scheiben von 7-10 nm Durchmesser, die aus sechs identischen Untereinheiten aufgebaut sind.

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Die Gattungen innerhalb der Siphoviridae unterscheiden sich hinsichtlich der Organisation des Genoms, den Mechanismen der DNA-Verpackung und dem Vorhandensein einer DNA-Polymerase. Einige Gattungen (λ-ähnliche bis L5-ähnliche Viren) haben ein isometrisches Kapsid, bei den anderen ist das Kapsid langgestreckt und nicht-isometrisch.

Wichtige Spezies der Familie sind der Lambda-Phage, Chi-Phage und der Phi80-Phage. Neben den bislang acht Gattungen umfasst die Familie auch 142 weitere Spezies, die keiner Gattung zugeordnet werden (z.B. der Bacillus-Phage Gamma).

Siphoviridae haben neben Bakterien auch Archaeen zum Wirt.

Systematik

Die Familie Siphoviridae umfasst folgende Gattungen und klassifizierte Spezies:

isometrisches Kapsid:

• Genus λ-ähnliche Viren (3 Spezies, 4 vorläufige Spezies)
  • Spezies Enterobacteria Phage HK022
  • Spezies Enterobacteria Phage HK97
  • Spezies Enterobacteria Phage λ (Lambda-Phage, auch Bakteriophage Lambda)
• Genus T1-ähnliche Viren (1 Spezies, 10 vorläufige)
  • Spezies Enterobacteria Phage T1
• Genus T5-ähnliche Viren (2 Spezies, 3 vorläufige)
  • Spezies Enterobacteria Phage T5
  • Spezies Vibrio Phage 149 (Typ IV)
• Genus L5-ähnliche Viren (2 Spezies, 4 vorläufige)
  • Spezies Mycobacterium Phage D29
  • Spezies Mycobacterium Phage L5

nicht-isometrisches Kapsid:

• Genus c2-ähnliche Viren (2 Spezies, 3 vorläufige, ca. 200 Subtypen)
  • Spezies Lactococcus Phage bIL67
  • Spezies Lactococcus Phage c2
• Genus ψM1-ähnliche Viren (1 Spezies, 2 vorläufige)
  • Spezies Methanobacterium Phage ψM1
• Genus φC31-ähnliche Viren (1 Spezies, 7 vorläufige)
  • Spezies Streptomyces Phage φC31
• Genus N15-ähnliche Viren
  • Spezies Enterobacteria Phage N15
  • Spezies Yersinia Phage PY54 (vorläufig)

Literatur

• C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004
• David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (eds.): Fields´ Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001