Short tandem repeat

Short tandem repeats sind repetitive DNA-Elemente und gehören zu den Satelliten-DNAs.

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Als Short tandem repeats (kurz STR, von englisch: Short - kurz, Tandem - im Sinne von hintereinander, Repeat - Wiederholung)
wird in der Genetik die Wiederholung kurzer Basenpaar-Muster hintereinander in einem DNA-Strang bezeichnet. Diese Muster bestehen aus 2-6 Basenpaaren und werden entsprechend ihrer Länge nach der biochemischem Nomenklatur wie folgt eingeteilt:

• 2 Basenpaare (bp) - dimerer STR
• 3 bp - trimerer STR
• 4 bp - tetramerer STR
• 5 bp - pentamerer STR
• 6 bp - hexamerer STR

Die Anzahl der Muster-Wiederholungen spielt in der Benennung keine Rolle.

Beispiel

Die Basenfolge TACTACTACTAC besteht aus der viermaligen Wiederholung TAC. TAC ist ein trimerer STR, da das Grundmuster aus 3 Basen (T für Thymin, A für Adenin, C für Cytosin) besteht

Anwendung

STRs sind bei der Identifizierung von Individuen und Verwandtschaftsanalysen von Bedeutung, da die Anzahl der Musterwiederholungen auch zwischen Verwandten verschieden sein kann.

Siehe auch

• Einteilung der repetitiven DNA Elemente, siehe repetitive DNA
• Satelliten-DNA
• Mikrosatelliten
• Alu-Sequenz
• DNA-Analyse,
• genetischer Fingerabdruck
• Polymorphismus