Um alle Funktionen dieser Seite zu nutzen, aktivieren Sie bitte die Cookies in Ihrem Browser.
my.bionity.com
Mit einem my.bionity.com-Account haben Sie immer alles im Überblick - und können sich Ihre eigene Website und Ihren individuellen Newsletter konfigurieren.
- Meine Merkliste
- Meine gespeicherte Suche
- Meine gespeicherten Themen
- Meine Newsletter
Gap (Bioinformatik)Ein Gap (engl.: Lücke) wird in der Bioinformatik als eine Lücke oder Leerstelle in einer Sequenz bezeichnet, insbesondere beim Sequenzalignment. Ein Gap bedeutet, dass an der entsprechenden Stelle in einer verwandten Sequenz ein weiteres Element steht. Weiteres empfehlenswertes FachwissenEs ist meist nicht bekannt, welche Sequenz evolutionär älter ist, also durch welche Art der Mutation die Sequenz verändert wurde. Bei einer Insertion wäre ein Element an der Stelle, an der sich jetzt das Gap befindet, eingefügt worden, bei einer Deletion wäre umgekehrt ein Element gelöscht worden, was zum Gap führt. Aufgrund dieser beiden Möglichkeiten werden Gaps auch als indels bezeichnet. GOP - gap opening penalty Kosten für das Beginnen einer Lücke GEP - gap extension penalty Kosten für das erweitern einer Lücke |
Dieser Artikel basiert auf dem Artikel Gap_(Bioinformatik) aus der freien Enzyklopädie Wikipedia und steht unter der GNU-Lizenz für freie Dokumentation. In der Wikipedia ist eine Liste der Autoren verfügbar. |