GC-Box

Die GC-Box ist ein an Guanin und Cytosin (Consensussequenz: GGGCGG) reiches regulatorisches Element der eukaryotischen Transkription. An diesen DNA-Abschnitt lagern sich für das Ablesen des nachfolgenden Gens benötigte Moleküle, die SP1-Transkriptionsfaktoren. Diese bewirken dann erst, dass die RNA-Polymerase II, das abzulesende Gen erkennt und sich an den Genanfang richtig positionieren kann. Die GC-Box liegt 60 bis 100 Nukleotide vor dem Startcodon.

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Diese Form der Transkriptionsinitiation ist relativ typisch für Genpromotoren ohne TATA-Box und ohne Downstream Promoter Element (DPE, unterhalb des Transkriptionsstartpunkts liegender Promotor).

Sie ist nicht zu verwechseln mit den CpG-Inseln, die 500–2000 bp vor Beginn des Transkripts liegen und aus CG-Wiederholungseinheiten bestehen. GC-Boxen werden auch nicht methyliert, wie es bei CpG-Inseln zur Genabschaltung der Fall sein kann.